一、基本情况
施传琳，中共党员，青年教授，副研究员，博士/博士后，江西省“赣鄱英才计划”创新领军人才，主要研究领域为水稻/野生稻群体重要农艺性状功能基因挖掘以及两系杂交稻雄性不育机制研究。迄今发表SCI论文26篇，其中以第一（含共同）或通讯作者发表论文10篇（中科院1区7篇，影响因子>10论文5篇），发表在Nature Plants、Plant Biotechnology Journal、New Phytologist、Plant Physiology、Plant Communications、Plant Journal等国际植物学权威期刊上。主持国家自然科学基金面上项目1项、国家自然科学基金青年项目1项，主持中国博士后科学基金1项，获深圳市博士后留深科研资助1项，入选江西省“赣鄱英才计划”创新领军人才，获中国农科院“优农计划”人才资助1项，获深圳市“鹏城孔雀计划”特聘岗位人才资助1项，参与国自然面上和重点项目各1项。获发明专利2项（第一完成人）和计算机软件著作权1项（第五完成人）。
二、个人简历（学习或者工作经历）
2025/5–至今，江西农业大学农学院，青年教授
2024/1–2025/5，中国农业科学院农业基因组研究所，副研究员
2020/8–2023/11，中国农业科学院深圳农业基因组研究所，博士后/助理研究员
2013/9月–2020/7，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所，硕博连读，博士
2009/9–2013/6，扬州大学，学士
三、主要研究方向
水稻（Oryza sativa L.）是我国最重要的主粮作物之一，发掘水稻重要农艺性状功能基因，解析两系、三系杂交稻不育基因遗传调控机制，是改良现代水稻品种、保障粮食安全的重要基础。本课题团队基于水稻/野生稻大规模群体、水稻突变体库，借助群体基因组、转录组、小RNA组和表观组等多组学技术、结合分子生物学研究方法，通过正/反向遗传学系统性挖掘和鉴定水稻雌雄育性和耐热、耐盐等抗逆重要农艺性状功能基因，解析其分子调控机理，建立水稻雌雄性育性和抗逆分子调控网络，为优质高产和抗逆杂交稻种质创新提供理论指导和遗传资源。
非常欢迎对水稻功能基因研究和育性调控、生物信息学和分子生物学感兴趣、积极上进的的优秀学子报考本实验室研究生！
四、近五年来研究成果
1. 主要论文：
（#第一作者，*通讯作者）
（1）Zhang, Y.#, Yang, Y.#, Shi, C.#, Pu, Q., Zhou, J., He, W., Xu, P., Xu, Q., Hu, F., Song, X., Jiang, X., Lv, Y., He, L., Deng, X., Shang, L.,* & Tao, D.* (2026). A distorter-restorer system drives quantitative reproductive isolation in rice. Nature Plants.
Zou, W.#, Zhu, Y.#, Li, J.#, Chen, Y., Meng, L., Ye, G.*, Shi, C.*. (2026). Molecular mechanisms of cadmium uptake, translocation and detoxification in rice: Implications for breeding Cd-safe varieties. Plant Stress.
（2）Chen, X.#, Lin, Y.#, Xi, X.#, Yang, S., Wu, S., Qian, H., Wu, M., Hu, T., Mei, F., Zheng, M., Shi, C.*, & Zhu, Y.* (2025). Generation of Novel High-Quality Small-Grained Rice Germplasm by Targeting the OsVIN2 Gene. Biology (Basel), 15(1).
（3）Shi, C.#, Zou, W.#, Liu, X.#, Zhang, H.#, Li, X., Fu, G., Fei, Q.*, Qian, Q.*, & Shang, L.* (2024). Programmable RNA N(6)-methyladenosine editing with CRISPR/dCas13a in plants. Plant Biotechnol J, 22(7), 1867-1880.
（4）Shi, C.#, Zou, W.#, Zhu, Y.#, Zhang, J.#, Teng, C., Wei, H., He, H., He, W., Liu, X., Zhang, B., Zhang, H., Leng, Y., Guo, M., Wang, X., Chen, W., Zhang, Z., Qian, H., Cui, Y., Jiang, H., Chen, Y., Fei, Q., Meyers, B. C., Liang, W.*, Qian, Q.*, & Shang, L.* (2024). mRNA cleavage by 21-nucleotide phasiRNAs determines temperature-sensitive male sterility in rice. Plant Physiol, 194(4), 2354-2371.
（5）Shi, C.#, Yang, S.#, Cui, Y.#, Xu, Z.#, Zhang, B., Guo, M., Zhu, Y., Yang, Y., Wang, F., Liu, H.*, Zhang, Y.*, Qian, Q.*, & Shang, L* (2024), Oxidative burst causes loss of tapetal Ubisch body and male sterility in rice. New Phytol, 244(1), 10-15.
（6）Xu, Z.#, Qu, M.#, Shi, C.#, Zhang, H., Chen, W., Qian, H., Zhang, Z., Qiu, J., Qian, Q.*, & Shang, L.* (2024). The MRE11-ATM-SOG1 DNA damage signaling pathway confers rice immunity to Xanthomonas oryzae. Plant Commun, 5(4), 100789.
（7）Li, X., Wei, Y., Fei, Q., Fu, G., Gan, Y., & Shi, C.* (2023). TurboID-mediated proximity labeling for screening interacting proteins of FIP37 in Arabidopsis. Plant Direct, 7(12), e555.
（8）Shi, C.#, Zhang, J.#, Wu, B., Jouni, R., Yu, C., Meyers, B. C.*, Liang, W.*, & Fei, Q.* (2022). Temperature-sensitive male sterility in rice determined by the roles of AGO1d in reproductive phasiRNA biogenesis and function. New Phytol, 236(4), 1529-1544
（9）Shi, C.#, Dong, N.Q., Guo, T., Ye, W.W., Shan, J.X., & Lin, H.X.* (2020). A quantitative trait locus GW6 controls rice grain size and yield through the gibberellin pathway. Plant J, 103(3), 1174-1188.
（10）Zhang, H., Chen, W., Zhu, D., Zhang, B., Xu, Q., Shi, C., He, H., Dai, X., Li, Y., He, W., Lv, Y., Yang, L., Cao, X., Cui, Y., Leng, Y., Wei, H., Liu, X., Zhang, B., Wang, X., Guo, M., Zhang, Z., Li, X., Liu, C., Yuan, Q., Wang, T., Yu, X., Qian, H., Zhang, Q., Chen, D., Hu, G., Qian, Q., & Shang, L. (2024). Population-level exploration of alternative splicing and its unique role in controlling agronomic traits of rice. Plant Cell, 36(10), 4372-4387.
（11）Wang, T., He, W., Li, X., Zhang, C., He, H., Yuan, Q., Zhang, B., Zhang, H., Leng, Y., Wei, H., Xu, Q., Shi, C., Liu, X., Guo, M., Wang, X., Chen, W., Zhang, Z., Yang, L., Lv, Y., Qian, H., Zhang, B., Yu, X., Liu, C., Cao, X., Cui, Y., Zhang, Q., Dai, X., Guo, L., Wang, Y., Zhou, Y., Ruan, J., Qian, Q., & Shang, L. (2023). A rice variation map derived from 10 548 rice accessions reveals the importance of rare variants. Nucleic Acids Res, 51(20), 10924-10933.
（12）Dong, N. Q., Sun, Y., Guo, T., Shi, C., Zhang, Y. M., Kan, Y., Xiang, Y. H., Zhang, H., Yang, Y. B., Li, Y. C., Zhao, H. Y., Yu, H. X., Lu, Z. Q., Wang, Y., Ye, W. W., Shan, J. X., & Lin, H. X. (2020). UDP-glucosyltransferase regulates grain size and abiotic stress tolerance associated with metabolic flux redirection in rice. Nat Commun, 11(1), 2629.
2. 科研项目：
（1）江西省“赣鄱英才计划”创新领军人才项目资助，gpyc20250041，2025年6月至2029年6月，80万元，主持
（2）国家自然科学基金，面上项目，32572332。2026年1月至2029年12月，50万元，主持
（3）国家自然科学基金，青年基金，32300300。2024年1月至2026年12月，30万元，主持
（4）中国博士后基金，面上项目，2021M703539。2022年1月至2023年12月，8万元，主持
（5）深圳市博士后留深科研资助，2024年1月至2026年12月，30万元，主持。
（6）国家自然科学基金委员会，面上项目，31771754。2018年1月至2021年12月，60万元，结题，参与
（7）国家自然科学基金委员会，重点项目，31630052。2017年1月至2021年12月，291万元，结题，参与
3. 人才项目
（1）江西省“赣鄱英才计划”创新领军人才项目资助
（2）中国农业科学院博士后“优农计划”人才重点资助
（3）深圳市“鹏城孔雀计划”特聘岗位人才资助
4. 发明专利：
（1）基于AGO1d基因编辑创建的水稻雄性低温温敏不育系及其应用，国家发明专利，专利号ZL202210295156.1，施传琳、费启立。（排名第1）
（2）植物RNA甲基化和去甲基化编辑方法及其应用，国家发明专利，申请专利，专利号202310432666.3，施传琳、邹文莉、商连光。（排名第1）
（3）水稻日本晴完整参考基因组组装及应用系统V1.0，计算机软件著作权，登记号2024SR0360375，商连光、贺文闯、王天依、许强、施传琳、魏华、吕阳。
五、联系方式
通讯地址：江西省南昌市经开区志敏大道1101号科技楼南301室
邮箱：chuanlinshi@126.com
